Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms