Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms