Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM6BO15054 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM6BO15054 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM6BO15054 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM6BO15054 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM6BO15054 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms