Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms