Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms