Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms