Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms