Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP69A5D8W1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP69A5D8W1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP69A5D8W1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP69A5D8W1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms