Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms