Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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