Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms