Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC180Q9P1Z9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC180Q9P1Z9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms