Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms