Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms