Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms