Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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FOXQ1Q9C009 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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