Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms