Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms