Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms