Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms