Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms