Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms