Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms