Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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