Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms