Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASSF3Q86WH2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms