Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms