Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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USP53Q70EK8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP53Q70EK8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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