Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms