Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q6P435 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q6P435 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Q6P435 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q6P435 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q6P435 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms