Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms