Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TYW3Q6IPR3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYW3Q6IPR3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms