Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms