Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms