Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms