Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms