Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms