Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms