Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms