Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms