Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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ECM1Q16610 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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ECM1Q16610 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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ECM1Q16610 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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ECM1Q16610 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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