Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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