Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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