Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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