Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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