Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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