Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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