Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP160Q12769 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUP160Q12769 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP160Q12769 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP160Q12769 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms