Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms