Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms